Tokyobezirk, im Jahre 2031. Ein gewaltiger Gastrea hat einen der Monolithen mit einer besonderen Flüssigkeit überzogen, die den einzigen Schutz vor den gefährlichen Monstern zersetzt. Wachmann Rentaro muss im Auftrag der Regierung ein Team zusammenstellen, um sich der näherrückenden Armee aus Gastrea zu stellen. Doch die Suche nach Gefährten gestaltet sich als schwierig, denn Rentaro ist nicht besonders beliebt. Kurz darauf bricht der Monolith frühzeitig zusammen. Und die dritte Schlacht um Kanto beginnt.